1993 wird Qualisys von Ingo Henckels gegründet, zunächst mit einem Schwerpunkt auf Datenservice für EU-Sicherheitsdatenblätter und einem zweiten Schwerpunkt in der Beratung und Auditierung nach ISO 9001. Dieses Wissen prägt noch heute die Arbeitsweise: Alle Daten sind dokumentiert, die Quellen nachvollziehbar und Entscheidungen begründbar.

Mit dem ersten SAP-Kunden beginnt Qualisys, Daten nicht nur mit der eigenen Anzeigesoftware SUMDAT Desktop auszuliefern. Zusätzlich werden Datenelemente und "Inbound Reports" über eine Einwahlverbindung (später ein Virtuell Privates Netz) in die Kunden-EDV integriert.

Mit dem Eintritt von Dr. Dirk Henckels entstehen erste Partnerschaften mit Softwarefirmen, um den Erfolg von Qualisys in zweiter Generation fortzuführen. Qualisys definiert seinen Schwerpunkt neu als Komplettanbieter von Gefahrstoffdaten und dazugehörigen Dienstleistungen sowohl für Endnutzer der Daten als auch für Softwareanbieter.

Drei Jahre später wählt die BDI-Arbeitsgruppe Standardtexte Qualisys als ihren Partner für Übersetzungen des Standards in europäische und außereuropäische Sprachen. Qualisys hat die Verbindung zwischen der Expertentätigkeit und IT-Lösungen intensiviert und so geholfen, leicht benutzbare Software zu erstellen.

Das Qualisys-Team ist in den letzten fünf Jahren kontinuierlich gewachsen. Auch die Kundenzahl hat sich seit Ende der 90er mehr als verdoppelt, die Zahl der Software-Partner sogar innerhalb eines Jahres. Mit verdoppelter Bürofläche legt Qualisys die Grundlage für Ausbau und Spezialisierung der Dienstleistungen.